通常來說，公鏈是自成一體的封閉系統，Achain不知道Bchain上發生了什么，Bchain也同樣不知道Achain上發生了什么。若要互換Achain的代幣Acoin和Bchain的代幣Bcoin，則必須依賴一個中間系統。

從表面上看，跨鏈原子交易似乎沒有中間系統，但可認為交易雙方及所使用的APP充當了中間系統，這個系統自動或通過人工持續監控Achain和Bchain之上的交易事件，完成或回退幣幣兌換。跨鏈原子交易主要適用于Bitcoin與模仿他的山寨幣系統之間的幣幣兌換，其技術原理對于普通用戶要求過高，交易雙方都需要理解幣幣兌換的實現原理，交易雙方還需要通過其他手段找到交易對手方。

對于擁有圖靈完備的智能合約編程功能的公鏈系統，實現幣幣兌換的功能，則更加方便、自然、通用。如下圖所示，Achain與Bchain的資產兌換，可通過交易所系統做為中介，只是左邊的中介本身也是一個公鏈，是去中心化的（DEX），右邊的則是中心化的交易所系統（EX）。DEX或EX為交易雙方提供了撮合服務。

EX存在的問題比較多，主要體現在兩方面：1、用戶需要無條件信任EX，用戶屬于極其弱勢的地位，資金安全得不到保障；2、EX自身可以用假數據對某些幣種進行拉盤和砸盤操作、并限制用戶的提幣行為，惡意操縱市場。

因此，我們需要DEX系統。在DEX的設計中，DEX只提供了撮合服務，并不能控制用戶的資金。用戶的資金存入開源的智能合約中，合約代碼不存在惡意隱藏的漏洞或后門，用戶可以隨時發送提幣交易，經過一段時間的延遲后，智能合約會自動將資金返還給用戶，用戶不在處于弱勢地位。

DEX還需要提供正確的操作時序邏輯，以模擬出類似跨鏈原子交易的功能。在DEX系統中，交易雙方的掛單數據是公開上鏈的，對外界是透明可見的，DEX系統自身不再有惡意操縱市場的可能了。

DEX的缺陷就是交易費用較高，交易處理速度較慢，因為在交易過程中，需要和公鏈系統做多次交互。EX則提供了高頻率低成本的交易服務，因為交易只涉及修改內部數據庫，并不涉及公鏈。但是DEX可提供的安全性及公平性是EX無法比肩的。