微流控芯片技術在單細胞基因組學研究中的應用
單細胞基因組學包括單細胞全基因組測序和以單細胞和微量細胞為材料的全基因組范圍內的基因功能研究。功能基因組學以結構基因組學所取得的靜態堿基序列信息為基礎,在全基因組水平上,高通量大規模的動態分析多種基因的表達及其調節,基因及其表達產物之間的相互作用,以及在不同層次、靜態和動態相結合及主動干預下基因作用對生物功能的影響。
圖1 中芯啟恒紫外***(Cchip-0019)
目前單細胞測序技術已廣泛應用于生物學各個基礎研究領域。其臨床應用轉化也已在多個領域開展了深入探索,包括腫瘤、生殖健康、 免疫系統疾病、感染性疾病(微生物) 等領域。目前單細胞相關臨床試驗的目的主要是評估單細胞測序在診斷、治療和監測各種類型的癌癥和感染(包括 HIV,肝炎和流感)中的價值,以及在器官和干細胞移植手術中提高成功率的應用等。
圖2 常用微流控芯片進樣設備
微流控平臺適合于分離單細胞,并且是公認的可以降低單細胞測序的噪聲,使得基因組擴展更加均勻。微流控技術的優點在于細胞分揀和單細胞的多重擴增可以在一張芯片上完成,而且依據芯片的設計,可以同時做多個細胞的擴增,做成芯片實驗室(Lab on a chip),擴增完成之后,收集擴增產物,檢測擴增產物的擴增質量就可以做相應的測序準備了,接下來測序和組裝跟宏觀基因組測序類似。
審核編輯:湯梓紅
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