四家位于英國的 NVIDIA 初創加速計劃會員公司使用 Cambridge-1 系統，借助 AI 和仿真推動醫療健康研究。

四家 NVIDIA 初創加速計劃會員公司拔得頭籌，成為首批使用英國最強大超級計算機 Cambridge-1 的初創公司。

這幾家英國公司分別是 Alchemab Therapeutics、InstaDeep、Peptone 和 Relation Therapeutics。他們將使用該系統，實現數字生物學方面的突破。

Cambridge-1 于 2021 年 7 月正式推出，是基于 NVIDIA DGX A100 系統、BlueField-2 DPU 和 NVIDIA InfiniBand 網絡的 NVIDIA DGX SuperPOD 集群，凝聚了 NVIDIA 在加速計算、AI 和生命科學領域數十年的工作成果。該計算機位于倫敦和劍橋之間，是全球最快的 50 臺計算機之一，并且 100% 采用可再生能源供電。

該超級計算機的五家創始合作伙伴已經在利用它來推動醫療健康領域的進展，利用 AI 研究癡呆等腦部疾病、研發新藥等。

現在，這四家初創公司計劃使用 Cambridge-1 來加速藥物研發、基因組測序和疾病研究。

這四家初創公司都是 NVIDIA 初創加速計劃會員，這項免費計劃旨在為初創公司提供尖端技術，助力他們顛覆行業發展。該計劃為會員提供量身定制的持續性福利，如 NVIDIA 深度學習培訓中心(DLI)積分、市場營銷支持和專家技術支持。

Alchemab Therapeutics：發現抗體療法

Alchemab Therapeutics 正在研究新藥靶標和治療方案，并構建患者分層工具，他們的初始目標是神經退行性疾病和癌癥。

Alchemab 技術主管 Jake Galson 表示，公司的抗體藥物研發引擎基于“大自然最有效的搜索引擎——適應性免疫”而構建。當人體的免疫系統對致病性蛋白質(如癌癥產生的蛋白質)或外來微生物(如感染)做出反應時，就會產生適應性免疫。

Alchemab 的平臺對 B 細胞進行測序(B 細胞會產生抵抗疾病的抗體)，并對容易感染某些疾病，但能夠快速康復的個體進行抗體反應計算分析。

“人體抗體的種類可能有約 10 萬億之多，而使用 Cambridge-1 為我們提供了獨特的機會，讓我們可以從如此海量的數據中解讀有意義的信息，” Galson 說，“這將加深我們對抗體結構和功能的理解，并最終推動新療法的問世。”

InstaDeep：為生物學創建決策系統

InstaDeep 是 NVIDIA 合作伙伴網絡的精英成員，致力于提供 AI 決策系統，助力推動新一代疫苗和療法的發展。

該公司正致力于使用基因組學數據來訓練大型 AI 語言模型，并與醫療健康研究人員共享該模型，使其能夠將此用于蛋白質設計和分子動力學仿真。

“公開可用的核苷酸序列有超過 120 億個，來自 450,000 個物種，” InstaDeep 聯合創始人兼首席執行官 Karim Beguir 說，“利用大規模模型，從基因組學測序中獲得數據驅動型洞察，將使研究人員和生命科學專家獲益匪淺。”

Beguir 表示，作為一家初創公司，使用 Cambridge-1 極大地增強了 InstaDeep 的“能力和雄心，進而迎難而上，為患者開發創新療法”。

Peptone：深入探索無序蛋白質

Peptone 是一家初創公司，在去年秋天獲得了 Cambridge-1 早期使用機會，他們正在開發一個名為 Oppenheimer 的物理引擎，該引擎將有助于研究人員了解固有無序蛋白質 (IDP) 的精確結構，這種蛋白質沒有固定的 3D 結構。

Peptone 創始人兼首席執行官 Kamil Tamiola 表示，IDP 疾病通常難以治療，但在 Cambridge-1 的助力下，Peptone 有望“將通常無藥可及的 IDP 轉化為合理的藥物靶標。”

“超級計算機將使我們能夠在幾個小時內，針對數百萬種蛋白質，并行地執行高吞吐量推理，”Tamiola 說，“Oppenheimer 將先進的原子級生物物理學實驗與基于 NVIDIA DGX A100 的新一代超級計算機堆棧整合起來。”

最終，該公司將使用這些計算結果，研發針對特定 IDP 的專有創新藥。

Relation Therapeutic：繪制疾病的病因圖

另一家初創公司 Relation Therapeutics 將單細胞分析、人類遺傳學、功能基因組學和機器學習相結合，以便更好地了解人體生物學的知識。

RelationTx 使用基于圖形的推薦系統技術來揭示疾病中的因果關系。RelationTx 的平臺可以識別生物學的具體領域，從而專注于藥物研發，加速研究目前尚未得到廣泛研究的疾病。

RelationTx 首席技術官 Lindsay Edwards 表示，公司的目標是改變藥物研發方式，從而找到新的疾病治療方法。

Edwards 說：“歸根結底，我們的使命是更快、更高效地為患者研發出新藥。Cambridge-1 幫助我們揭開了之前幾乎無法理解的生物學領域，例如基因變異如何影響人體內部復雜組織和器官系統的基因表達。”

進一步了解 AI 在醫療健康領域的應用

這些初創公司將在數字生物學領域開展突破性工作，而 Cambridge-1 的創始公司已經在利用該系統的強大性能。

阿斯利康 和 NVIDIA 使用該超級計算機開發了 MegaMolBART 的最新迭代，MegaMolBART 是一種自然語言處理模型，可讀取化合物的文本格式，并使用 AI 生成新的分子。該化學轉換模型能夠利用 NVIDIA NeMo Megatron 框架，訓練帶有 10 億多參數的化學語言模型。

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原文標題：GTC22 | 首批初創公司率先使用英國最強大的超級計算機，實現數字生物學領域的突破

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審核編輯：湯梓紅