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NVIDIA nvCOMP中的兩個統(tǒng)一接口和使用

星星科技指導(dǎo)員 ? 來源:NVIDIA ? 作者:Eric Schmidt ? 2022-04-06 17:02 ? 次閱讀

壓縮可以在各種用例中提高性能,例如 DL 工作負(fù)載、數(shù)據(jù)庫和通用 HPC 。在 GPU 上,壓縮可以加速協(xié)作工作流的 GPU 間通信。它可以通過在數(shù)據(jù)存儲到全局內(nèi)存之前壓縮數(shù)據(jù)來增加單個 GPU 可以處理的數(shù)據(jù)集的大小。它還可以加速 CPU 和 GPU 之間的數(shù)據(jù)鏈路。

為了讓這些工作流中的任何一個都變得有用,壓縮和解壓縮必須快速,并且在給定數(shù)據(jù)集上以足夠高的壓縮比運行,才能發(fā)揮作用。然而,不同算法的壓縮比和吞吐量因數(shù)據(jù)集而異。如果沒有大量關(guān)于算法和數(shù)據(jù)統(tǒng)計的專業(yè)知識,可能很難選擇最佳算法。

NVIDIA NVCOMP 庫使您可以在應(yīng)用程序中結(jié)合高性能 GPU 壓縮和解壓縮。該庫提供了一組統(tǒng)一的 API ,允許您快速交換壓縮格式,以在數(shù)據(jù)集上實現(xiàn)最佳性能,而對代碼的更改最少。

使用 nvCOMP ,您可以快速、輕松地使用不同的算法進(jìn)行實驗,以找到最適合您的用例的算法。在最近的版本中,我們更新了 nvCOMP 以進(jìn)一步改進(jìn)和統(tǒng)一接口。在新發(fā)布的 2.2 版本中,我們提供了一個易于使用的、高級的 C ++ API 和一個通用的低級別批量 C API 。在本文中,我們將詳細(xì)介紹這兩個接口。你還可以學(xué)習(xí)如何有效地使用它們,以及何時應(yīng)該選擇其中一個。

高級 API

高級 API 更易于使用,并抽象了向 GPU 公開并行性的工作。當(dāng)您必須將連續(xù)緩沖區(qū)壓縮為連續(xù)的壓縮緩沖區(qū)時,它最有用。例如,在通過網(wǎng)絡(luò)發(fā)送緩沖區(qū)或?qū)⑵浔4娴酱疟P之前壓縮緩沖區(qū)時,這種方法效果很好。

以下示例使用高通量GDeflate壓縮格式。GDeflate類似于 deflate ,可以有效地映射到數(shù)據(jù)并行架構(gòu),如 GPU 。如果您對使用的壓縮格式?jīng)]有限制,那么這是一個很好的起點。

高級接口是基于nvcompManagerBase類層次結(jié)構(gòu)的C++ API。每個派生的Manager類都在nvcomp/include中與其關(guān)聯(lián)的頭中聲明。例如,本文中使用的GDeflateManager在nvcomp/include/gdeflate.hpp中聲明。

首先,構(gòu)建所需的Manager類。每個Manager構(gòu)造函數(shù)都有一組唯一的參數(shù);然而,有一些觀點通常是一致的。所有子類都允許使用指定的流 ID 構(gòu)造用于所有內(nèi)核和內(nèi)存?zhèn)鬏敗D€可以指定要使用的設(shè)備 ID 。如果不為這兩個參數(shù)指定值,則使用默認(rèn)的流和設(shè)備。

另一個常見的輸入是未壓縮的塊大小。這在壓縮過程中用于將緩沖區(qū)拆分為獨立的塊進(jìn)行處理。較大的塊大小通常會導(dǎo)致更高的壓縮比,但代價是暴露在 GPU 中的并行性會降低。一個好的起始數(shù)據(jù)塊大小是 64KB ,但是可以自由地使用這些值來探索數(shù)據(jù)集的相關(guān)權(quán)衡。

Manager類也使用特定于格式的參數(shù)構(gòu)造。您可以查看nvcomp/include中的相關(guān)標(biāo)題,了解Manager類構(gòu)造函數(shù)參數(shù)的描述,并了解如何為所選格式構(gòu)造Manager對象。

const size_t uncomp_chunk_size = 64 * 1024; cudaStream_t stream;
cudaStreamCreate(&stream));
const int gdeflate_algorithm = 0; // Use standard GDeflate
const int device_id = 0; // Use the default device GdeflateManager gdeflate_manager{chunk_size, gdeflate_algorithm, stream, device_id};

nvcompManager需要一個臨時的 scratch 工作區(qū)來進(jìn)行壓縮和解壓縮。根據(jù)特定的壓縮格式參數(shù)以及壓縮和解壓縮內(nèi)核的最大占用率,所需的暫存空間大小是固定的。如果對您的用例有意義,您可以在構(gòu)造后使用set_scratch_buffernvcompManager對象提供一個臨時緩沖區(qū)。

size_t scratch_buffer_size = gdeflate_manager.get_required_scratch_buffer_size();
uint8_t* scratch_buffer;
cudaMalloc(&scratch_buffer, scratch_buffer_size);
gdeflate_manager.set_scratch_buffer(scratch_buffer);

手動設(shè)置暫存緩沖區(qū)可能有助于控制用于此分配的內(nèi)存分配方案。如果您同意默認(rèn)設(shè)置,我們建議跳過此步驟并啟用nvcompManager對象來處理分配。

此緩沖區(qū)可用于nvcompManager執(zhí)行的所有壓縮和解壓縮操作。如果nvcompManager對象分配了暫存緩沖區(qū),則在銷毀該對象時會釋放該緩沖區(qū)。

壓縮

現(xiàn)在可以壓縮緩沖區(qū)了。首先,使用configure_compression API 配置壓縮。此異步操作返回CompressionConfig對象。

配置步驟只需要input-uncompressed緩沖區(qū)的大小。您必須分配一個 GPU 可訪問的內(nèi)存緩沖區(qū),其大小至少為該大小,以用作壓縮例程的結(jié)果緩沖區(qū)。有了這些信息,可以執(zhí)行壓縮,如下面的代碼示例所示:

CompressionConfig comp_config = gdeflate_manager.configure_compression(input_buffer_len); uint8_t* comp_buffer;
cudaMallocAsync(&comp_buffer, comp_config.max_compressed_buffer_size, stream); gdeflate_manager.compress(uncomp_buffer, comp_buffer, comp_config);

您還可以在 GPU 上排隊進(jìn)行其他壓縮。

uint8_t* comp_buffer1, comp_buffer2;
CompressionConfig comp_config1 = gdeflate_manager.configure_compression(input_buffer_len1); cudaMallocAsync(&comp_buffer1, comp_config1.max_compressed_buffer_size, stream); gdeflate_manager.compress(uncomp_buffer1, comp_buffer1, comp_config1); CompressionConfig comp_config2 = gdeflate_manager.configure_compression(input_buffer_len2); cudaMallocAsync(&comp_buffer2, comp_config2.max_compressed_buffer_size, stream); gdeflate_manager.compress(uncomp_buffer2, comp_buffer2, comp_config2); cudaStreamSynchronize(stream);

減壓

高級接口壓縮產(chǎn)生的緩沖區(qū)在壓縮數(shù)據(jù)之前包含一個頭(圖 1 )。此標(biāo)題包含有關(guān)緩沖區(qū)如何壓縮的信息,因此您可以從壓縮的緩沖區(qū)構(gòu)造nvcompManager對象,而不知道它是如何壓縮的。這使您可以在不知道緩沖區(qū)是如何壓縮的情況下對其進(jìn)行解壓縮。

A diagram showing an example nvCOMP HLIF-compressed bufferA diagram showing an example nvCOMP HLIF-compressed buffer

圖 1 HLIF 壓縮數(shù)據(jù)格式

為此,請使用nvcompManagerFactory.hpp中聲明的create_manager API 。這個同步 API 將壓縮的緩沖區(qū)以及可選的流和設(shè)備 ID 作為輸入。

auto decomp_nvcomp_manager = create_manager(comp_buffer, stream);

如果您已經(jīng)掌握了有關(guān)緩沖區(qū)壓縮方式的信息,那么可以使用前面描述的配置構(gòu)造一個新的管理器。您還可以重用用于壓縮的同一nvcompManager對象來執(zhí)行解壓縮。這些方法的優(yōu)點是不需要同步流。

給定一個nvcompManager對象和一個壓縮的緩沖區(qū),解壓的執(zhí)行與壓縮類似,但有幾個細(xì)微的區(qū)別。首先,有兩種可能的方式來進(jìn)行解壓縮配置。如果壓縮使用CompressionConfig對象,則可以完全異步配置解壓縮。

DecompressionConfig decomp_config = gdeflate_manager->configure_decompression(comp_config);

該 API 的一個示例用例是大型神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練。可以使用的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)或訓(xùn)練集的大小取決于 GPU 的內(nèi)存容量。使用壓縮,您可以有效地增加此容量,而無需將數(shù)據(jù)卸載到 CPU 或使用多個 GPU 。

具體來說,基于反向傳播的訓(xùn)練包括在向前傳球時計算激活圖,然后在向后傳球的計算中重用它們。這些激活映射比較大且相對稀疏,因此非常適合壓縮。使用gdeflate_manager壓縮地圖,并在內(nèi)存中保存網(wǎng)絡(luò)各層的壓縮緩沖區(qū)和CompressionConfig對象。這可以實現(xiàn)完全異步的反向傳播,包括解壓縮。

如果沒有使用的CompressionConfig對象,也可以使用壓縮緩沖區(qū)配置解壓縮。這是一個同步操作,必須從設(shè)備執(zhí)行cudaMemcpyAsync操作。所有同步都在nvcompManager構(gòu)造函數(shù)中指定的流上,并且不是設(shè)備范圍的。

DecompressionConfig decomp_config = gdeflate_manager->configure_decompression(comp_buffer);

與壓縮一樣,在同步流之前,您可以一次將多個解壓縮項目排隊。

uint8_t* res_decomp_buffer1, res_decomp_buffer2;
DecompressionConfig decomp_config1 = gdeflate_manager->configure_decompression(comp_config1);
DecompressionConfig decomp_config2 = gdeflate_manager->configure_decompression(comp_config2); cudaMallocAsync(&res_decomp_buffer1, decomp_config1.decomp_data_size, stream);
cudaMallocAsync(&res_decomp_buffer2, decomp_config2.decomp_data_size, stream); gdeflate_manager->decompress(res_decomp_buffer1, comp_buffer1, decomp_config1);
gdeflate_manager->decompress(res_decomp_buffer2, comp_buffer2, decomp_config2); cudaStreamSynchronize(stream));

最后,在高級 API 中有兩種類型的錯誤檢查:std::runtime_error異常和檢查nvcompStatus_t值。

如果任何 CUDA API 失敗,就會引發(fā)std::runtime_error異常。您可以在應(yīng)用程序中捕獲這些錯誤,也可以不處理它們,在這種情況下,您的應(yīng)用程序會失敗,并顯示一條描述錯誤的消息。例如,如果您提供的輸出緩沖區(qū)大小不足或無法在 GPU 上訪問,就會發(fā)生這種情況。

錯誤檢查的第二種形式是檢查CompressionConfig或DecompressionConfig對象中的nvcompStatus_t值。此狀態(tài)在相關(guān)的內(nèi)核調(diào)用期間設(shè)置。損壞的輸入緩沖區(qū)和其他錯誤會觸發(fā)它。

低級 API

低級 API 為更高級的工作流提供了 C API 。低級 API 同時壓縮和解壓縮您提供的一批獨立塊。這取決于您對數(shù)據(jù)進(jìn)行分塊,并提供足夠數(shù)量的分塊來利用 GPU 的并行處理能力。

如果有許多獨立的、不連續(xù)的緩沖區(qū),這是處理數(shù)據(jù)最有效的方法。低級 API 避免了將生成的壓縮塊打包到單個連續(xù)的壓縮緩沖區(qū)的工作量。它還避免了與在高級 API 中保存有關(guān)緩沖區(qū)如何壓縮的信息相關(guān)的壓縮比開銷。

該工作流非常適合數(shù)據(jù)庫應(yīng)用程序,例如,在這些應(yīng)用程序中,往往需要壓縮或解壓縮許多獨立的列。這個 API 用于 RAPIDS 和 NVIDIA Spark 實現(xiàn)。

壓縮

對于低級 API 中的壓縮,必須分配一個臨時暫存緩沖區(qū)。臨時緩沖區(qū)與高級 API 中描述的類似。然而,緩沖區(qū)大小取決于輸入緩沖區(qū)的大小,因此必須重新定義它,并可能與每一組新的用戶輸入一起重新分配。

size_t temp_bytes;
nvcompBatchedGdeflateCompressGetTempSize(batch_size, chunk_size, nvcompBatchedGdeflateDefaultOpts, &temp_bytes); void* device_temp_ptr;
cudaMalloc(&device_temp_ptr, temp_bytes);

接下來,應(yīng)該計算批處理中壓縮塊的最大大小。這允許您分配一組結(jié)果緩沖區(qū)。在下面的示例中,batch_size是要處理的塊數(shù)。結(jié)果指針的設(shè)備數(shù)組在復(fù)制到設(shè)備之前在固定的主機(jī)內(nèi)存中構(gòu)造。

size_t max_out_bytes;
nvcompBatchedGdeflateCompressGetMaxOutputChunkSize(chunk_size, nvcompBatchedGdeflateDefaultOpts, &max_out_bytes); // Allocate output space on the device
void ** host_compressed_ptrs;
cudaMallocHost((void**)&host_compressed_ptrs, sizeof(size_t) * batch_size);
for(size_t ix_chunk = 0; ix_chunk < batch_size; ++ix_chunk) { cudaMalloc(&host_compressed_ptrs[ix_chunk], max_out_bytes);
} void** device_compressed_ptrs;
cudaMalloc(&device_compressed_ptrs, sizeof(size_t) * batch_size);
cudaMemcpy( device_compressed_ptrs, host_compressed_ptrs, sizeof(size_t) * batch_size,cudaMemcpyHostToDevice);

通過計算所有這些輸入,您現(xiàn)在可以異步進(jìn)行壓縮,如圖所示。

nvcompStatus_t comp_res = nvcompBatchedGdeflateCompressAsync( device_uncompressed_ptrs, device_uncompressed_bytes, chunk_size, batch_size, device_temp_ptr, temp_bytes, device_compressed_ptrs, device_compressed_bytes, nvcompBatchedGdeflateDefaultOpts,

減壓

要開始解壓,請根據(jù)壓縮的緩沖區(qū)預(yù)計算解壓的大小。如果您已經(jīng)有此信息,請?zhí)^此步驟。

nvcompBatchedGdeflateGetDecompressSizeAsync( device_compressed_ptrs, device_compressed_bytes, device_uncompressed_bytes, batch_size, stream);

與壓縮類似,您還必須計算所需的臨時大小,并分配臨時暫存緩沖區(qū)。

size_t decomp_temp_bytes;
nvcompBatchedGdeflateDecompressGetTempSize(batch_size, chunk_size, &decomp_temp_bytes);
void * device_decomp_temp;
cudaMalloc(&device_decomp_temp, decomp_temp_bytes);

最后,可以進(jìn)行異步解壓縮。

nvcompStatus_t decomp_res = nvcompBatchedGdeflateDecompressAsync( device_compressed_ptrs, device_compressed_bytes, device_uncompressed_bytes, device_actual_uncompressed_bytes, batch_size, device_decomp_temp, decomp_temp_bytes, device_uncompressed_ptrs, device_statuses, stream);

標(biāo)桿管理

nvCOMP 為低級和高級格式的每種格式提供了一組基準(zhǔn)。圖 2 比較了在幾個不同的數(shù)據(jù)集上使用大型連續(xù)緩沖區(qū)時高級和低級的性能。使用 A100 GPU 收集結(jié)果。

Bar chart shows decompression throughputs on different datasets. The high-level performance nearly matches the low-level performance.

Bar chart shows decompression throughputs on different datasets. The high-level performance nearly matches the low-level performance.

圖 2a 各種數(shù)據(jù)集的解壓縮吞吐量。

Bar chart shows compression ratios on different datasets. The high-level performance nearly matches the low-level performance.

Bar chart shows compression ratios on different datasets. The high-level performance nearly matches the low-level performance.

圖 2b 各種數(shù)據(jù)集的壓縮比。

Bar chart shows compression ratios on different datasets. The high-level performance nearly matches the low-level performance

Bar chart shows compression ratios on different datasets. The high-level performance nearly matches the low-level performance

圖 2c 各種數(shù)據(jù)集的壓縮吞吐量

從結(jié)果中可以看出,在使用大型連續(xù)緩沖區(qū)時,低級和高級 API 之間的性能差異可以忽略不計。使用哪一個取決于您的用例。如果有許多小緩沖區(qū),請使用低級 API ,或者避免與高級 API 相關(guān)的內(nèi)存占用。

圖 3 顯示了日志規(guī)模下不同緩沖區(qū)大小的性能。為了產(chǎn)生這些結(jié)果,圖 2 中顯示的 mortgage int 數(shù)據(jù)集被分成許多批batchSize,如圖所示。該文件超過 314 MB 。對于 1 MB 的批量大小,執(zhí)行 315 次壓縮和解壓縮操作。批量大小為 400 MB 時,執(zhí)行單個壓縮和解壓縮操作。

以這種方式批處理數(shù)據(jù)不會影響低級批處理 API 。

a bar chart showing high-level compression throughput at various batch sizes, compared to the low-level performance. The high-level performance suffers for smaller batch sizes.

a bar chart showing high-level compression throughput at various batch sizes, compared to the low-level performance. The high-level performance suffers for smaller batch sizes.

圖 3a :在 314 MB 文件上運行的各種批量大小的壓縮吞吐量。

a bar chart showing high-level decompression throughput at various batch sizes, compared to the low-level performance. The high-level performance suffers for smaller batch sizes.

a bar chart showing high-level decompression throughput at various batch sizes, compared to the low-level performance. The high-level performance suffers for smaller batch sizes.

在 314 MB 文件上操作的各種批量大小的解壓縮吞吐量。

正如所證明的,對于小批量,高級接口的性能會嚴(yán)重下降。這顯示了在壓縮或解壓縮許多較小的緩沖區(qū)時使用低級批處理 API 的實用性。低級批處理 API 可以使用更少、占用率更高的內(nèi)核來完成操作,而高級 API 需要許多具有相關(guān)尾部效應(yīng)和占用率問題的小型內(nèi)核啟動。

我們在庫中加入了基準(zhǔn)測試應(yīng)用程序,以便您可以嘗試不同的壓縮格式,并查看哪種格式對您的數(shù)據(jù)最有效。提供的基準(zhǔn)是benchmark_hlif和benchmark_《format》_chunked。有關(guān)更多信息,請參閱 nvCOMP README 。

總結(jié)

現(xiàn)在,您已經(jīng)了解了如何使用高級 nvCOMP API 來輕松壓縮和解壓縮。您已經(jīng)了解了何時使用低級 API 更好,以及如何使用它。

關(guān)于作者

Eric Schmidt 是 NVIDIA 的高級開發(fā)技術(shù)工程師。 Eric 目前正在 GPU 上加速壓縮例程。在 2021 加入 NVIDIA 之前,埃里克在航天工業(yè)中花了 11 年的時間在應(yīng)用數(shù)學(xué)中開發(fā)軟件和研究算法。

審核編輯:郭婷

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