我們使用BDF進行azulene的S1激發態結構優化和頻率計算。選中Simulator → BDF → BDF,界面中設置參數。在Basic Settings界面中的Calculation Type選擇TDDFT-OPT+Freq,方法采用默認的GB3LYP泛函,基組在Basis中的All Electron類型中,選擇6-31G(d,p)。SCF Settings和TDDFT Settings面板中將Use MPEC+COSX Acceleraton的默認勾選去掉。Basic Settings、SCF Settings、TDDFT Settings界面中的其它參數以及OPT Settings、Freq Settings等面板的參數使用推薦的默認值,不需要做修改。之后點擊 Generate files 即可生成對應計算的輸入文件。
選中生成的bdf.inp文件,右擊選擇open with,打開該文件,如下所示:
$compass
Title
C10H8
Geometry
C 0.79273796 0.49102542 -0.00003307
C -0.70229649 0.61186591 0.00000000
C 1.30022932 1.80163337 -0.00006272
C -0.99262499 1.98726800 0.00007812
C 1.54415132 -0.67887418 0.00000000
C -1.63318173 -0.42094563 -0.00002837
C 0.21877157 2.69859813 0.00000000
C 1.10656346 -2.00562676 0.00005788
C -1.41619168 -1.80093044 -0.00004814
C -0.20258112 -2.49333483 0.00000000
H 2.35092512 2.06249889 -0.00009828
H -1.98777600 2.41348149 0.00017650
H 2.62424717 -0.53731745 0.00001117
H -2.67585843 -0.10561277 -0.00001521
H 0.30641472 3.77916915 0.00002386
H 1.88966566 -2.75951313 0.00017581
H -2.31053950 -2.41870505 -0.00009019
H -0.29054446 -3.57807510 0.00000000
End Geometry
Basis
6-31G(d,p)
Skeleton
Group
C(1)
$end
$bdfopt
Solver
1
MaxCycle
108
IOpt
3
Hess
final
$end
$xuanyuan
Direct
$end
$scf
RKS
Charge
0
SpinMulti
1
DFT
GB3LYP
D3
Molden
$end
$tddft
Imethod
1
Isf
0
Idiag
1
Iroot
6
Istore
1
$end
$resp
Geom
Method
2
Nfiles
1
Iroot
1
$end
選中bdf.inp文件,右擊選擇Run提交作業,任務結束后bdf.out,bdf.out.tmp,bdf.scf.molden三個結果文件會出現在Project中。 選擇bdf.out,右擊show view,在Optimization對話框中,顯示結構已經達到收斂標準。
在Frequency對話框中,檢查頻率,若不存在虛頻證明結構已經優化到極小點。
選擇bdf.out.tmp,右擊open with containing folder,打開bdf.out.tmp,在文件開始向下查找第一個tddft計算模塊‘module tddft’。根據tddft模塊的Ground to excited state Transition electric dipole moments (Au) 中的State 1的躍遷電偶極矩,得到momap需要的參數EDMA,計算方法為:需要將單位a.u.轉換為Debye,因此EDMA= 0.3646*2.5417=0.9267 Debye。
在文件末尾向上查找第一個tddft計算模塊‘module tddft’。根據tddft模塊的Ground to excited state Transition electric dipole moments (Au) 中的State 1的躍遷電偶極矩,得到momap需要的參數EDME,計算方法為:需要將單位a.u.轉換為Debye,因此EDMA= 0.3646*2.5417=0.6507 Debye。 ?
在該tddft模塊的Statistics for [dvdson_rpa_block]:中讀取No. 1態的能量為 -385.8030478000 a.u.,即為S1態的單點能。 將S1態的單點能與S0態的單點能相減,即得momap需要的兩態的能量差參數Ead=0.07502 a.u.。
基于基態結構,做S0和S1之間的非絕熱耦合計算。點擊azulene_s0.hzw,右擊點擊copy,設置new file name為nacme,在Project中出現nacme.hzw。雙擊nacme.hzw,使用BDF進行azulene的非絕熱耦合計算。選中Simulator → BDF → BDF,界面中設置參數。在Basic Settings界面中的Calculation Type選擇TDDFT-NAC,方法采用默認的GB3LYP泛函,基組在Basis中的All Electron類型中,選擇6-31G(d,p)。SCF Settings和TDDFT Settings面板中將Use MPEC+COSX Acceleraton的默認勾選去掉。在TDDFT Settings面板中的Non-Adiabatic Coupling內容框中,在默認的Coupling between Ground and Excited-State下,點擊‘+’號,Basic Settings、SCF Settings、TDDFT Settings界面中的其它參數以及OPT Settings、Freq Settings等面板的參數使用推薦的默認值,不需要做修改。之后點擊 Generate files 即可生成對應計算的輸入文件。
選中生成的bdf.inp文件,右擊選擇open with,打開該文件,如下所示:
$compass
Title
C10H8
Geometry
C 0.79273796 0.49102542 -0.00003306
C -0.70229648 0.61186591 0.00000000
C 1.30022931 1.80163336 -0.00006271
C -0.99262499 1.98726799 0.00007812
C 1.54415131 -0.67887417 0.00000000
C -1.63318173 -0.42094562 -0.00002837
C 0.21877157 2.69859812 0.00000000
C 1.10656346 -2.00562675 0.00005788
C -1.41619168 -1.80093044 -0.00004813
C -0.20258112 -2.49333482 0.00000000
H 2.35092512 2.06249888 -0.00009827
H -1.98777599 2.41348149 0.00017649
H 2.62424717 -0.53731744 0.00001117
H -2.67585843 -0.10561277 -0.00001520
H 0.30641472 3.77916915 0.00002385
H 1.88966565 -2.75951312 0.00017580
H -2.31053950 -2.41870504 -0.00009018
H -0.29054446 -3.57807510 0.00000000
End Geometry
Basis
6-31G(d,p)
Skeleton
Group
C(1)
$end
$xuanyuan
Direct
$end
$scf
RKS
Charge
0
SpinMulti
1
DFT
GB3LYP
D3
MPEC+COSX
Molden
$end
$tddft
Imethod
1
Isf
0
Idiag
1
Iroot
6
Istore
1
$end
$resp
Quad
FNAC
Norder
1
Method
2
Nfiles
1
Single
States
1
1 1 1
$end
選中bdf.inp文件,右擊選擇Run提交作業,任務結束后bdf.out,bdf.scf.molden三個結果文件會出現在Project中。 至此,MOMAP對azulene的S1→S0的輻射速率和內轉換速率的計算需要的BDF量化軟件的結構優化頻率結果文件、非絕熱耦合結果文件和參數部分都已完成。 下一期會接著介紹使用MOMAP進行azulene的S1→S0的輻射速率和內轉換速率的計算。
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模塊
+關注
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耦合
+關注
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100799 -
計算
+關注
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38740
原文標題:鴻之微量化軟件計算賞析|量化理論計算探究薁(azulene)的反Kasha規則熒光機制(二)
文章出處:【微信號:hzwtech,微信公眾號:鴻之微】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。
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