在Shell編程中，常用命令包括以下幾種：

1. ls：列出目錄中的文件和子目錄。
2. cp：復制文件或目錄。
3. cat：查看文件的內容，可以用于合并文件。
4. touch：創建一個新文件或更新已存在文件的訪問和修改時間。
5. rm：刪除文件或目錄。
6. mkdir：創建目錄。
7. rmdir：刪除空目錄。
8. echo：輸出字符串或變量的值。
9. grep：在文件中搜索指定的字符串模式。
10. find：在目錄樹中搜索文件，并根據條件進行匹配。
11. diff：比較兩個文件的差異。
12. patch：將補丁文件應用于源文件，以生成新的補丁文件。
13. tr：用于字符轉換、刪除和壓縮的實用程序，可以用于刪除文件中的控制字符或進行字符轉換。

這些命令在Shell編程中非常常用，可以幫助你完成文件和目錄的操作、文本處理等任務。需要注意的是，不同的操作系統和Shell環境可能會有一些差異，因此在使用這些命令時需要參考相應的文檔或手冊。
當然，以下是更多的常用命令：

14. chmod：改變文件或目錄的權限。
15. chown：改變文件或目錄的所有者和組。
16. chmod：查看和修改文件或目錄的權限。
17. ps：顯示當前運行進程的狀態信息。
18. top：實時顯示進程活動和系統負載。
19. kill：發送信號到進程，通常用于終止進程。
20. ssh：遠程登錄或在主機之間執行命令。
21. scp：在主機之間復制文件。
22. ping：發送 ICMP ECHO_REQUEST 到網絡主機。
23. ifconfig / ip：顯示或配置網絡接口。
24. netstat：顯示網絡連接、路由表、接口統計等等。
25. wget：從網絡上下載文件。
26. curl：傳輸數據，支持各種協議。
27. tail：顯示文件的最后幾行。
28. head：顯示文件的前幾行。
29. cut：從文件的每行中剪切出字符的一部分。
30. sort：對輸入進行排序，或合并文本文件。

這些命令涵蓋了文件和目錄管理、進程管理、網絡管理以及文本處理等許多方面，對于Shell編程來說是非常有用的工具。記住這些命令以及它們的基本用法，會讓你的工作更加高效。