借助主成分得分對河南省各市進行聚類分析。在進行聚類分析時，指標越多就會使樣品間的共性顯示得越少，太多的指標會使計算出的樣品間的距離偏大，從而不利于樣品間相似性的綜合和聚類分析的進行，往往達不到所想要的分類效果。SPSS軟件可以在不知道最終類別個數的情況下，畫出完整的聚類分析譜系圖，因此下面用SPSS軟件對河南省18個市進行聚類分析。

在spss中打開數據，選擇分析→分類→系統聚類：

變量選擇f1，f2得分，聚類選擇個案，勾選輸出統計量和繪圖;

點擊設置統計量，默認選擇即可

點擊選擇分類方法，這里選擇了離差平方和法；

點擊繪制，勾選樹狀圖，這個是我們輸入查看譜系圖的依據：

確定查看譜系圖，分析聚類結果，改用不同的分類方法，得到譜系圖進行綜合分析；

由于方法眾多，這里選取最為常用較結合實際的離差平方和法進行分析，這里僅給出分組的結果，即聚類分析的方法，每個分組的分析較長不再贅述。

SPSS聚類分析樹狀圖常見問題及解決方法

一、Excel里的數據，第一行應為標簽。如：第一列是菌株，第二列第三列為“二”，“三”都行，但必須有，否則spss讀取數據的時候會把第一行數據當做標簽不予處理。

二、spss打開數據，選擇open，文件選擇all file，Excel數據就可以打開了。（注意，如果有些項目是缺省值，則須補零，否則后面輸出的時候則會出現缺失值，即次樣品不予處理，直接會被計算機排除）

三、選擇字體（非常重要，直接導致后面輸出圖的美觀，很多人都倒在了這一步，我也是，后來用word，photoshop處理后，還湊合，但也不是很理想），在編輯選項Edit，中選擇options，進去后viewer，出來對話框，有兩個字體選項，上面選擇Tahoma，下面（Text output font ），選擇Courier New。字號均選擇10號。

四、分析，點擊analyze——Classify——Hierarchical cluster analysis——數據導入variables，表頭（標簽）項導入label case by；點擊statistics，Ag和Pr均選中，下面Range of solutions（聚類數） 選中，一般選擇3-10，Continue 。選擇Method 項，Standardize選擇Z scores，Continue，點擊Plots選擇dendrogram（打對勾），Save中Range of solutions（聚類數） 同statistics，點擊ok即可生成各種圖表，包括樹狀圖。

五、此時可以根據自己的需要選擇輸出，或是截圖。輸出的話可以點擊文件，Export，可以選擇輸出格式，如word，ppt等格式。。截圖一般可以分成三段，在用photoshop等作圖軟件拼接。

（以上步驟是根據我自己的分析需要做出來的，如果需要其他分析方法，則可已改動里面相應選項進行分析）