就通信方式討論：（以下不論ARM核嵌入式低端高端均稱為單片機）

　　單片機間通信可用UART或SPI串口通信，UART適合速率不高，為了兼容低端單片機的場合。SPI比較通用，而且速率可高至單片機核心時鐘的1/4（但單片機IO速率低的要注意不能超過單片機IO速率）。高端單片機，如STM32F103系列，帶有DMA，可減輕CPU負擔。

　　單片機與PC通信，一般用串口或USB接口。串口或用MAX232芯片與PC串口相連，或用USB轉UART芯片（PL2302等）橋接。USB口需單片機帶USB接口模塊，或USB橋接芯片，或用軟件模擬（僅業余使用，商品或工業使用不推薦）。

　　就USB接口討論：

　　單片機所帶USB接口多為device接口，很少有host接口。單片機與PC相連，單片機一般做device角色。

　　STM32部分型號帶有USB接口。USB接口使用一般是先配置USB屬性，諸如設備類別，VID（供應商ID（特別說明，需要向usb協會申請購買）） PID（產品識別碼），顯示名稱，供電屬性等等信息。

　　配置好的USB，方可被計算機識別。

　　USB通信一般只能由PC向USB設備發起，有命令，批量讀取，批量寫入等操作。一般情形是通過命令進行簡單的控制或確定寫入或讀取地址，然后通過批量讀寫傳輸數據。

　　一般USB設備開發，都需要編寫上位機驅動。除非做成 USB HID 類協議，因為操作系統一般是帶有HID驅動的，但缺點很明顯，HID協議較復雜，且傳輸速率低。

　　上位機也要經過枚舉設備，選擇設備，打開設備等等一系列復雜操作。

　　區別：單片機間通信一般需自定協議，相對自由；單片機與上位機通信一般依靠現有協議，然后自定需要的功能協議。

　　單片機間通信機動性高，可利用中斷等特性，非惡劣環境一般不需復雜控制可保證正常工作。

　　與上位機通信，一般受上位機等復雜環境影響，需考慮的方面比較多。

　　寫到這才想起來。。樓主說的單片機間通信是近距離通信還是遠距離通信？。。。我按照在同一設備內考慮的。若是較遠距離，一般速率做不高，依靠485協議，或CAN協議等，甚至有的直接將通信放到局域網環境上。未見單片機間通過USB協議通信的，因為USB OTG實現很復雜。