BOOT區的由來基于一個簡單的道理，即單片機的程序是保存在FLASH中的，要運行程序就必須不停的訪問FLASH存儲器。對于一般的FLASH存儲器，數據的寫入需要一定的時間來完成，在數據寫入完成之前，存儲器中所有的數據都是不可讀的，這就在運行舊程序和寫入新程序之間造成了一個矛盾。使用BOOT區是解決這個矛盾的方法之一，它將FLASH存儲器從物理上分為兩個獨立的區域，對其中的一個區的數據寫入不會影響到另一個區的數據讀取操作。我們可以讓單片機的程序在其中一個區（通常是BOOT區）運行，而運行著的程序代碼寫入另外一個區（通常為應用程序區）內。 AVR高檔單片機ATmega系列中含有BOOT代碼區，即程序引導區，也可稱器件自身監控區，有了此 BOOT區監控，該器件就可對自己器件的Flash程序存儲器及EEPROM數據存儲器進行讀、寫操作，即實現自編程功能，也可稱IAP在系統應用中編程，這種自編程程序區我們稱其用戶管理程序，簡稱用戶程序。 BOOT區大小可根據實際需要用寄存器設定，并可鎖定加密，使外界無法讀取其監控。如果BOOT區監控設計得好，可把該器件的主要、關鍵控制對象放在BOOT區監控內（如中斷控制），其它工作讓用戶自己設計，可變成傻瓜式控制器、檢測儀，可遠程對嵌入式設備進行檢測、維護、升級等操作。也可通過有線、無線網絡監控設備。實現秀才不出門，也可管世界。這種帶BOOT區監控的AVR器件，可應用于程序、數據需變動的場合;可用于自適應、自修正場合;可用于閉環控制，人工智能; 可用于統一計量、計價，又必須在同一時間內快速調正的設備中（例：IC卡計費電話機）; 可用于…… 有了BOOT區監控，用戶程序可通過單片機通訊口與PC機RS232接口來寫用戶程序，可省去AVR串行或并行下載電纜，這對外出維護設備帶來方便。雙龍SL-MEGA8開發實驗器出廠就提供BOOT區演示監控，用標準RS232通訊電纜就可做程序下載實驗（對Flash程序存儲器及EEPROM數據存儲器實驗擦、寫、讀取）。這樣對有的AVR高檔單片機編程方法有：編程器編程，ISP串行、并行下載編程，JTGA線編程，IAP在應用中編程（僅用串行通訊線）多種形式，給科研、生產帶來方便。可以自己設計編程器件，對用戶將提供 BOOT區監控方案框架，你只需簡單連接，就可組成自己的BOOT區監控。以上設計思想也適合所有AVR高檔單片機ATmega系列中含帶有BOOT代碼區的器件。