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在生物信息學中，建立生物二次數據庫可以針對特定物種進行更深入的研究。針對分子生物學二次數據庫資源平臺的構建的迫切需要，利用biosql構建了分子生物學二次數據庫，運用tomcat 6.0+ Myeclipse+mysql技術，MVC開發模式，實現了以抗逆基因為例的web資源數據庫平臺。該平臺解決了分子生物二次數據庫的構建與抗逆基因數據自動獲取，能及時接受研究者數據的上傳和抗逆基因的快速檢索。該平臺同樣可以應用到其他類別的分子生物，加快了對某一范圍內分子生物學的研究，使研究更具針對性。
生物信息學就其本身字面意義是所有關于生物的信息研究的學科。但是一般意義上的生物信息學就專門指關于分子水平的各種生物大分子序列、結構和功能上的信息研究。分子生物信息數據庫主要包括基因組數據庫、核酸和蛋白質序列數據庫、蛋白質構數據庫等初始數據庫，以及由此而構建的二次數據庫、復合數據庫，即面向生物學家具有各種不同特色或特殊用途的專門數據庫。自人類基因組計劃從20世紀90年代開始啟動后，對分子生物研究與日俱增，然而相關數據庫資源平臺卻屈指可數。一般而言，生物信息數據庫可以分為一級數據庫和二級數據庫。一級數據庫的教據都直接來源于實驗獲得的原始數據，只經過簡單的歸類整理和注釋。國際上著名的三大核酸數據庫NCBI的Genebank、日本的DDBJ和EBI的EMBL數據庫都是建立二次數據庫的數據來源。BioPerl作為Perl語言專門用于生物信息的工具與函數模塊集，是世界各地的perl開發在生物信息學、基因組學以及其他生命科學領域的智能結晶。利用BioPerl構建分子數據庫是研究人員廣泛使用的方法，已經形成了行業標準。
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