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      電子發(fā)燒友網(wǎng)>電子資料下載>電子論文>數(shù)字信號處理論文>DNA片段拼接中的預(yù)歸并重復(fù)序列屏蔽方法

      DNA片段拼接中的預(yù)歸并重復(fù)序列屏蔽方法

      2009-03-21 | rar | 191 | 次下載 | 5積分

      資料介紹

      針對DNA 片段拼接中的重復(fù)序列識別及屏蔽問題，提出一種預(yù)歸并重復(fù)序列屏蔽方法。在片段拼接前通過掃描子串標(biāo)識出可能存在重疊關(guān)系的shotgun 片段，利用子串歸并該相關(guān)片段，標(biāo)識出重復(fù)序列的位置信息，達(dá)到屏蔽的目的。計算機(jī)模擬分析表明，該方法識別重復(fù)序列的錯誤率低，通過預(yù)歸并有效縮減了shotgun 集合的規(guī)模，降低了拼接時的計算復(fù)雜度。
      關(guān)鍵詞：片段拼接；預(yù)歸并；重復(fù)序列；屏蔽
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