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      電子發燒友網>電子資料下載>電子論文>網絡協議論文>基于粗糙集和PSO、遺傳算法的基因調控網絡構建方法

      基于粗糙集和PSO、遺傳算法的基因調控網絡構建方法

      2017-12-09 | rar | 0.73 MB | 次下載 | 1積分

      資料介紹

      　　MicroRNA（ miRNA）是一類大小為21 - 25 nt的內源性非編碼小核糖核酸（RNA），通過與mRNA的3’一UTR互補結合，導致mRNA降解或翻譯抑制來調控編碼基因的表達。為了提高構建基因調控網絡的準確度，提出一種基于粗糙集、融合粒子群（ PSO）和遺傳算法（GA）的基因調控網絡構建方法（PSO-（;A-RS）。該方法首先通過對序列信息進行特征提取；然后采用粗糙集的依賴度作為適應度函數，融合粒子群和遺傳算法選出較優的特征子集；最后使用支持向量機（SVM）建立模型，預測未知的調控關系。在擬南芥數據集上進行實驗，相比基于粗糙集和粒子群優化的特征選擇方法和Rosetta算法，所提方法的預測準確率、F值和受試者工作特征（ROC）曲線面積最多能提高5%，在水稻數據集上最多能提高8%。實驗結果表明所提方法能夠比較準確地預測miRNA和靶基因之間的調控關系。

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