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      RNA-Seq差異異構(gòu)體比例檢測(cè)方法

      2017-11-23 | rar | 0.54 MB | 次下載 | 免費(fèi)

      資料介紹

      　　近年來，RNAseq技術(shù)被廣泛應(yīng)用于差異表達(dá)基因和異構(gòu)體的檢測(cè)，但目前大多數(shù)方法都是識(shí)別單個(gè)異構(gòu)體的差異表達(dá)，無法同時(shí)檢測(cè)同一個(gè)基因中所包含異構(gòu)體表達(dá)比例的差異，因此提出一個(gè)差異異構(gòu)體比例檢測(cè)方法。該方法基于先前設(shè)計(jì)的sl。DASeq模型，運(yùn)用該模型中隱含變量的概率分布，采用KI。散度進(jìn)行差異異構(gòu)體比例的分析。首先使用最新的SEQC數(shù)據(jù)集評(píng)估sLDASeq模型表達(dá)水平的性能，結(jié)果表明該方法能準(zhǔn)確地估計(jì)基因中異構(gòu)體的比例。接著通過模擬數(shù)據(jù)集進(jìn)行差異異構(gòu)體比例的檢測(cè)，與其他方法相比，實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明該方法在差異異構(gòu)體比例檢測(cè)方面具有較高的準(zhǔn)確性。

      RNA-Seq差異異構(gòu)體比例檢測(cè)方法

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